一般的佛珠都有一个佛头，就是那个吉祥结下面那一颗，叫佛头珠，也叫主珠，主珠跟其他珠子相比，有一个特点，就是被钻有三个孔，因为让绳子从上面还要伸出来穿住佛塔或者叫佛帽。所以，主珠也叫三通珠。
有的佛珠有三通佛头，有的没有。确实是这样，大部分佛珠都有三通佛头，少数没有，都是一样的珠子穿在一起，这样，也没有佛塔，也没有吉祥结。大部分的沉香佛珠和檀香佛珠没有三通佛头，这个可能跟台湾有关，因为台湾做的佛珠都是这样的，而沉香、檀香类的产品，以前一直是台湾人做得最多。
念珠不管是什么样的，不管是哪个地方生产的，都会有佛头三通。因为长珠是为了念佛计数用的，而计数就必须要有一个佛头三通，做为区别，拨动到这里的时候，就知道：念完108遍了。这样方便计数。但是手珠一般不是为了念佛计数用的，主要是为了把玩或者装饰，当然也是为了佛力加持。这样，从念佛的角度来说，就不必如长珠那样非要一个佛头三通了。
这里的讲究，其实没有刻意的讲究，非要说讲究，也有。
有三通的，代表皈依三宝。主珠代表佛，其他珠代表僧，绳代表法。没有三通的，代表诸法平等，心无挂碍。
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